扁平疣主要是由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起的，尤其是HPV - 3型、HPV - 5型等亚型。据统计，约65%的扁平疣患者是通过直接接触传染的，比如与扁平疣患者共用毛巾、脸盆等个人物品。
病毒传播途径：
直接接触传播： 当健康人的皮肤有微小破损时，接触到扁平疣患者病变部位的皮肤，就有可能被感染。例如，在学校、家庭等人群密集的场所，如果有同学或家人患有扁平疣，共用贴身物品就容易引发感染。间接接触传播： 接触被患者污染的物品，如被患者用过的文具、玩具等，也可能感染HPV从而引发扁平疣。虽然这种传播方式相对直接接触来说概率较低，但也不能忽视。
自身因素影响：
免疫力低下人群： 当人体免疫力下降时，比如长期熬夜、过度劳累、患有慢性疾病等情况，身体对HPV的抵御能力减弱，就更容易感染扁平疣。例如，一些长期从事高强度工作、作息不规律的人，相比免疫力正常的人，感染扁平疣的风险会高很多。皮肤屏障受损者： 皮肤受到外伤、晒伤等导致屏障功能受损时，也容易让HPV侵入。比如，皮肤被划伤后没有及时正确处理，就为HPV感染提供了可乘之机。
好发人群特点：
青少年群体： 青少年的免疫系统还在发育阶段，相对比较脆弱，所以是扁平疣的高发人群之一。据临床观察，16 - 30岁的青少年中扁平疣的发病率相对较高。他们活泼好动，皮肤接触机会多，而且免疫力相对成年人更容易出现波动，增加了感染HPV的可能性。皮肤敏感人群： 本身皮肤比较敏感的人，皮肤的自我保护能力相对较弱，更容易受到HPV的侵袭。这类人群在日常生活中需要更加注意皮肤的防护，避免接触可能感染HPV的源。