小孩牙齿上有黑点的可能原因包括食物色素沉着、牙结石、龋病。具体如下：
一、食物色素沉着：如果小孩近期食用了较多颜色较深的食物，比如巧克力、酱油、可乐等，且口腔清洁没有做好，就会导致食物色素在局部牙面上沉积，进而在临床上呈现出牙齿有黑点的情况。
二、牙结石：当小孩口腔卫生不佳，牙面上附着大量菌斑、软垢，这些菌斑、软垢不断沉积并逐渐钙化形成结石，刚形成的结石质地较软，一段时间后会硬化成黄白色至棕黑色，于是就会出现小孩牙齿上有黑点的现象。
三、龋病：由于小孩口腔卫生不良，致使口内积存大量食物残渣，这些食物残渣促进了细菌繁殖，从而侵蚀牙釉质形成龋坏。在龋坏初期，表现为牙面窝沟点隙发黑，探诊时可钩住探针，随着龋坏进一步加重，牙面会逐渐形成龋洞，也就表现为牙齿有黑点。
总之，小孩牙齿出现黑点可能是多种原因引起的，需要根据具体情况进行判断和处理。