精子畸形的原因有很多，常见的有以下几点：
1.精索静脉曲张：精索静脉曲张会导致睾丸局部温度升高，血管活性物质增加，从而影响精子的发生。
2.生殖道感染：附睾、输精管、精囊和前列腺等生殖道或生殖腺体的急慢性炎症都可降低精子的运动能力，导致精子畸形。
3.内分泌异常：体内某些相关激素的分泌不平衡，会影响精子的发育，导致畸形率上升。
4.营养不良：特别是维生素A、E和微量元素锌的缺乏，常可导致精子畸形。
5.吸烟酗酒：吸烟和酗酒是精子畸形的重要因素，会导致精子活力降低，畸形率升高。
6.其他因素：长期使用某些药物、阴囊局部长期高热、长期接触放射性物质、阴囊损伤等，也可导致精子畸形。