肛门瘙痒的原因多样，若因湿疹引起，可使用糖皮质激素药膏，如氢化可的松乳膏，一般短期使用能缓解症状，但连续使用不宜超过2周。
因肛周湿疹导致的肛门瘙痒用药
糖皮质激素药膏： 像氢化可的松乳膏，它能起到抗炎、抗过敏的作用，减轻湿疹引起的瘙痒，但连续使用通常不建议超过2周，避免出现皮肤萎缩等不良反应。钙调磷酸酶抑制剂： 比如他克莫司软膏，适用于面部、颈部等皮肤薄嫩部位以及儿童患者，它通过抑制钙调磷酸酶来发挥免疫抑制作用，缓解瘙痒，且不会引起皮肤萎缩等问题，但起效相对慢一些。
由寄生虫感染引发的肛门瘙痒用药
抗寄生虫药物： 要是蛲虫感染导致的肛门瘙痒，可使用阿苯达唑片，它是广谱驱虫药，能抑制虫体对葡萄糖的吸收，让虫体无法存活，但2岁以下儿童禁止使用阿苯达唑。局部外用药： 同时可以外用蛲虫膏，睡前清洗肛周后涂抹，能起到杀虫、止痒的作用。
因肛瘘导致的肛门瘙痒用药
抗生素类药物： 当肛瘘急性发作出现感染时，可短期使用抗生素，如头孢克肟分散片，它能抑制细菌生长，减轻炎症，从而缓解瘙痒，但不能长期使用，避免产生耐药性。坐浴药物： 还可以用高锰酸钾溶液坐浴，一般配置成1:5000的浓度，每天坐浴1 - 2次，每次15 - 20分钟，能清洁肛周、促进血液循环，辅助缓解瘙痒，但高锰酸钾溶液浓度要准确，不然会刺激皮肤。
由痔疮引起的肛门瘙痒用药
痔疮膏： 像马应龙麝香痔疮膏，有清热燥湿、活血消肿、去腐生肌的作用，能缓解痔疮引起的肛门瘙痒、肿痛等症状。栓剂： 肛泰栓也是常用的，塞入肛门后能起到凉血止血、清热解毒、消肿止痛的功效，减轻痔疮相关的瘙痒不适。