三个月宝宝一边脸大一边脸小，要依具体情况判断，可能是长期一侧睡觉或发育不良所致，可通过调整睡姿、补充足够营养或手术等方法来处理。
一、调整睡姿
如果宝宝长时间保持一侧睡觉姿势，会造成局部血液流通受阻，进而出现脸部大小不一的状况。所以家长应及时调整宝宝的睡姿，避免其长期保持同一侧睡觉，这样一般能够逐渐缓解症状。
二、补充足够营养
产妇在怀孕期间若未能保证充足的营养，就可能导致宝宝出现发育不良的情况，从而影响宝宝的正常发育。此时可根据医生的建议，适当补充钙、维生素D等营养物质。
三、手术治疗
要是宝宝经过上述治疗方式后，症状仍未得到缓解，那就需要及时到医院，在医生的指导下选择手术进行治疗。
平时要注意合理喂养宝宝，防止其出现营养不良的情况，同时还需注意避免宝宝长期使用一侧咀嚼食物、睡觉。
总结：对于三个月宝宝一边脸大一边脸小的情况，要明确原因，可通过调整睡姿、补充营养或必要时手术等方法来改善，日常也要做好相关注意事项。