阴茎根部的小硬疙瘩可能是多种疾病的表现，以下是一些可能的原因：
1.皮脂腺囊肿：这是一种常见的良性肿瘤，通常由于皮脂腺排泄管阻塞，皮脂囊状上皮被逐渐增多的内容物膨胀所形成。囊肿呈圆形，位于阴茎根部，单发或多发，质地硬，边界清楚，无压痛，可以推动。皮脂腺囊肿一般无自觉症状，如继发感染时可有疼痛、化脓。
2.传染性软疣：这是由传染性软疣病毒感染引起的传染性皮肤病。初起为米粒大的半球形丘疹，逐渐增大至豌豆大，中心微凹，表面有蜡样光泽，呈灰白色或珍珠色。可以挤出白色乳酪样物质，称为软疣小体。好发于儿童和青年人，主要通过直接接触传染，也可自体接种。
3.尖锐湿疣：这是一种由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起的性传播疾病。初起为细小淡红色丘疹，以后逐渐增大增多，单个或群集分布，湿润柔软，表面凹凸不平，呈乳头样、鸡冠状或菜花样突起。红色或污灰色。根部常有蒂，且易发生糜烂渗液，触之易出血。皮损裂缝间常有脓性分泌物郁积，致有恶臭，且可因搔抓而引起继发感染。本病常无自觉症状，部分病人可出现异物感、痛、痒感或性交痛。直肠内尖锐湿疣可发生疼痛、便血、里急后重感。
4.阴茎硬结症：这是一种发生在阴茎海绵体两层筋膜之间的一种结缔组织增生性疾病，多见于中年人，原因尚未明确。硬结可在阴茎背侧或根部，或发生于阴茎侧面，或累及阴茎全体，小者如米粒，大者如花生米。阴茎勃起时，会发生弯曲或疼痛。
5.其他：阴茎根部的小硬疙瘩还可能是脂肪瘤、纤维瘤、梅毒硬下疳等疾病的表现。
如果你发现阴茎根部有小硬疙瘩，建议及时就医，由医生进行详细的检查和诊断，并根据具体情况给予相应的治疗。