扁桃体反复发炎多是由病原微生物感染及自身免疫等因素引起。据统计，儿童扁桃体反复发炎的发生率相对较高。
一、病原微生物感染因素
1. 细菌感染：
A组乙型溶血性链球菌： 这是引发扁桃体反复发炎较常见的细菌。这种细菌容易在人体抵抗力下降时趁虚而入，比如当孩子过度疲劳、受凉后，就可能被其感染，从而导致扁桃体发炎，且容易反复。葡萄球菌： 金黄色葡萄球菌等葡萄球菌也是常见的致病菌。它们会在扁桃体部位定植繁殖，引发炎症反应，若身体免疫力不能有效清除，就会导致扁桃体反复发炎。
2. 病毒感染：
腺病毒： 腺病毒感染也常导致扁桃体反复发炎。腺病毒可通过飞沫、接触等途径传播，感染后会在扁桃体部位引发炎症，而且腺病毒感染后机体产生的免疫力相对较弱，所以容易出现反复感染扁桃体的情况。鼻病毒： 鼻病毒感染也可能累及扁桃体，引起扁桃体发炎，尤其在季节交替等免疫力容易波动的时候，鼻病毒容易侵袭人体，导致扁桃体反复受到影响而发炎。
二、自身免疫因素
1. 变态反应：
当人体处于过敏状态时，可能会引发自身免疫反应累及扁桃体。例如，孩子可能对空气中的某些过敏原，如花粉、尘螨等过敏，当接触过敏原后，免疫系统异常激活，攻击扁桃体组织，导致扁桃体反复发炎。
2. 扁桃体隐窝引流不畅：
扁桃体隐窝内如果有堵塞，分泌物引流不畅，就容易滋生细菌等病原体。比如隐窝内的食物残渣、脱落上皮等堆积，为细菌的生长繁殖提供了良好的环境，从而导致扁桃体反复发炎，即使没有明显的外界病原体入侵，也可能因为隐窝内环境的问题而反复出现炎症反应。
三、其他因素
1. 邻近器官炎症蔓延：
如鼻窦炎、咽炎等邻近器官的炎症可以蔓延至扁桃体，引发扁桃体发炎。例如鼻窦炎患者，鼻腔内的炎症分泌物可能会倒流至扁桃体部位，刺激扁桃体导致发炎，而且如果邻近器官的炎症不能得到有效控制，就会使得扁桃体反复受到牵连而发炎。
2. 生活习惯因素：
长期吸烟、酗酒的人，咽喉部受到的刺激较大，容易导致扁桃体局部抵抗力下降，从而容易反复发炎。另外，缺乏锻炼、营养不良等也会影响身体的免疫力，使得扁桃体更容易受到病原体的侵袭而反复发炎，比如一些营养不良的儿童，扁桃体反复发炎的概率相对较高。