乳腺囊肿的治疗方法主要包括一般治疗、药物治疗、手术治疗及其他治疗。
一、一般治疗
主要是随访观察。单纯性囊肿很多是通过体检做乳腺彩超发现的，有少数患者囊内液体可自行吸收。要是囊肿较小且增大不明显，通常定期复查就行。而哺乳期的积乳囊肿，有可能在断奶后逐渐变小或消失。但若是复杂性囊肿或不能排除恶性的可能，那就应尽早进行手术治疗。
二、药物治疗
常见药物有逍遥散、小金丸、布洛芬。
1.患者可口服具有软坚散结作用的中药，比如逍遥散、小金丸等，可用于治疗乳房胀痛，能起到散结消肿、化瘀止痛的功效。不过大部分患者经药物治疗效果不太理想，需要选择其他治疗方法。
2.布洛芬能缓解患者疼痛，但可能会出现消化不良、胃烧灼感、胃痛、恶心、呕吐等不良反应。
三、手术治疗
手术切除：当囊肿体积较大时，或者患者自身比较在意、心理负担较重时，应实施手术切除。传统手术切除后疤痕会比较明显，如果患者在意外观也可选择微创手术。
四、其他治疗
穿刺抽吸：在超声引导下用注射器抽吸囊液，之后可以送病理进行细胞学检查。患者可反复抽吸，通常抽吸3至4次后很少会再次复发。超声引导穿刺治疗技术疗效显著且安全性较高。
总结：目前针对乳腺囊肿没有特效药物，药物治疗效果因人而异。手术治疗的复发率比其他操作略高，且手术创伤会影响局部美观。超声引导下的穿刺治疗相比之下术区更美观，疗效更好，复发率也较低。