解脲衣原体感染主要是通过性接触传播，大约50%的非淋菌性尿道炎是由解脲衣原体引起的。此外，母婴传播也是一个重要途径，母亲生殖道感染解脲衣原体时，新生儿通过产道分娩可被感染。
性接触传播为主因
性活跃人群易感染： 15 - 24岁性活跃的人群感染风险相对较高，因为这个阶段性行为相对频繁，在没有安全防护措施的情况下，很容易通过性接触感染解脲衣原体。例如，有多个性伴侣的人比单一性伴侣的人感染解脲衣原体的几率要高很多。不安全的性行为： 没有使用安全套等防护措施的性行为，会大大增加解脲衣原体传播的可能性。因为解脲衣原体可以存在于感染者的生殖道分泌物中，在性接触过程中很容易传播给对方。
母婴传播不可忽视
分娩时的感染： 孕妇如果感染了解脲衣原体，在分娩过程中，新生儿经过产道时就有可能被感染，从而引发新生儿结膜炎或者肺炎等疾病。据统计，约40% - 50%的新生儿结膜炎是由解脲衣原体感染引起的。母婴垂直传播的风险： 孕妇感染解脲衣原体后，除了分娩时的直接感染，还可能通过胎盘等途径影响胎儿，虽然这种情况相对较少，但也存在一定的风险，可能会导致胎儿发育异常等问题。
间接传播也有可能性
公共卫生设施传播： 在一些公共浴室、游泳池等公共卫生设施中，如果卫生条件不佳，解脲衣原体有可能通过接触被污染的物品间接传播。不过这种情况相对较少见，但也不能完全排除。例如，使用被解脲衣原体污染的毛巾、浴盆等物品，就有被感染的可能，但相比性接触和母婴传播，概率要低很多。密切生活接触： 与感染者密切生活在一起，共用毛巾、衣物等个人物品，也存在一定的间接传播风险。但一般来说，这种传播方式的效率远低于性接触传播和母婴传播。