引起毛囊炎的原因有多种。一般来说，毛囊受到细菌感染是常见原因之一，像金黄色葡萄球菌就很容易引发毛囊炎。
细菌感染导致
金黄色葡萄球菌感染： 金黄色葡萄球菌是引发毛囊炎较为常见的细菌。当皮肤有微小破损时，这种细菌就可能侵入毛囊，从而引起毛囊的炎症反应。比如皮肤被擦伤、抓伤等，就为金黄色葡萄球菌的入侵创造了条件。表皮葡萄球菌感染： 表皮葡萄球菌也会导致毛囊炎。它在皮肤表面正常菌群中存在，但当皮肤的防御功能下降时，就可能大量繁殖引发炎症。
皮肤卫生状况不佳
油脂分泌过多： 有些人皮脂腺分泌旺盛，皮肤表面油脂较多。如果不及时清洁，油脂会堵塞毛囊口，为细菌滋生提供了环境，进而容易引发毛囊炎。例如青春期的青少年，由于体内激素变化，皮脂腺分泌旺盛，若不注意皮肤清洁，就较易出现毛囊炎。清洁不彻底： 长期不洗澡或者洗澡时清洁不到位，皮肤表面的污垢、灰尘等会堆积，堵塞毛囊，增加毛囊炎的发生风险。比如长时间处于户外工作，皮肤沾染大量灰尘后未及时清洁，就可能引发毛囊炎。
机体免疫力低下
患有基础疾病： 像糖尿病患者，由于血糖控制不佳，机体免疫力相对较低，容易受到细菌感染，从而增加患毛囊炎的几率。还有艾滋病患者，免疫系统受损，更容易发生各种感染，包括毛囊炎。长期使用免疫抑制剂： 一些患有自身免疫性疾病需要长期使用免疫抑制剂的患者，其机体免疫力被抑制，抵御细菌等病原体的能力下降，也容易引发毛囊炎。例如患有红斑狼疮长期使用糖皮质激素等免疫抑制剂的患者。