男性性功能障碍的检查方法有多种。一般来说，医生首先会进行详细的病史采集，了解患者的性生活情况、疾病史、用药史等。比如要询问患者勃起持续时间、硬度情况，以及是否存在早泄等问题的时间跨度等。
体格检查方面
生殖系统检查： 医生会检查外生殖器，包括阴茎的外观、大小、有无畸形，睾丸的大小、质地，附睾是否有结节等。例如，正常睾丸大小一般有一定范围，通过触诊可以初步判断是否存在异常。全身检查： 还会进行全身系统检查，因为一些全身性疾病也可能导致性功能障碍，像心血管系统检查，查看血压、脉搏等，了解心血管功能情况，因为心血管疾病可能影响阴茎血流从而导致性功能问题。
实验室检查项目
血液检查： 会检测性激素水平，如睾酮等。一般来说，成年男性睾酮水平有正常范围，通过血液检测可以判断是否存在性激素异常导致的性功能障碍。还可能检查血糖、血脂等指标，因为高血糖、高血脂等代谢性疾病与性功能障碍相关。尿液检查： 可以检测尿常规等，了解是否存在泌尿系统感染等疾病，泌尿系统感染等问题可能影响性功能。
特殊检查手段
夜间阴茎勃起监测： 这是一种很重要的检查方法。男性在睡眠中会有自然的阴茎勃起，通过监测夜间阴茎勃起情况，可以区分性功能障碍是心理性还是器质性的。例如，正常男性夜间睡眠时会有3 - 5次勃起，每次持续10 - 30分钟左右，如果夜间阴茎勃起正常，多考虑心理性因素；如果异常则可能是器质性问题。阴茎血流检测： 通过超声等手段检测阴茎动脉血流情况和静脉闭合功能。比如超声多普勒检查，可以了解阴茎海绵体动脉的血流速度等，判断是否存在血管性因素导致的性功能障碍。