肺气肿的药物治疗需根据病情来选择，常用的药物有支气管舒张剂、糖皮质激素等。一般来说，支气管舒张剂中的短效β₂受体激动剂，像沙丁胺醇气雾剂，能在几分钟内起效，缓解气喘症状；长效的沙美特罗等也可使用。糖皮质激素如布地奈德福莫特罗粉吸入剂，既有抗炎作用又能舒张支气管。
支气管舒张剂类药物
短效支气管舒张剂： 像沙丁胺醇气雾剂，它能快速缓解肺气肿患者的气喘症状，通常吸入后几分钟就能起效，可临时用于缓解突发的呼吸困难。长效支气管舒张剂： 沙美特罗属于长效β₂受体激动剂，作用时间较长，一般能维持12小时左右，能持续改善肺气肿患者的气流受限情况，提高生活质量。
糖皮质激素相关药物
吸入性糖皮质激素： 布地奈德就是常见的吸入性糖皮质激素，它可以减轻气道炎症，长期使用能减少肺气肿患者急性加重的次数。不过使用时要注意可能出现口腔念珠菌感染等副作用，使用后需漱口。复方制剂： 布地奈德福莫特罗粉吸入剂，里面既含有糖皮质激素布地奈德，又有长效支气管舒张剂福莫特罗，能同时起到抗炎和舒张支气管的作用，对于中重度肺气肿患者效果较好。
祛痰药
氨溴索： 它可以降低痰液的黏度，使痰液更容易咳出，对于肺气肿伴有痰多的患者比较适用。一般可以口服，也能静脉给药，能帮助改善患者的呼吸状况。乙酰半胱氨酸： 也具有祛痰作用，它能使痰液中的黏蛋白双硫键断裂，降低痰液的黏稠度，让痰液稀释，利于排出，对肺气肿患者的排痰有帮助。
抗菌药物
当有感染时使用： 如果肺气肿患者出现咳嗽加重、痰液变黄变脓等感染迹象时，可能需要使用抗菌药物。比如阿莫西林克拉维酸钾，它对常见的引起肺部感染的细菌有抗菌作用；如果患者对青霉素类药物过敏，还可以选用阿奇霉素等大环内酯类抗菌药物来抗感染治疗，但使用抗菌药物需由医生根据感染情况来决定是否使用及选择具体药物。