新生儿出现甲减的病因主要有以下两大类：
一、散发性先天性甲减：
1.与甲状腺发育相关的问题：
(1)胎儿期甲状腺发育不全、甲状腺异位或不完全发育，这类情况在女孩中较为多见，其中甲状腺异位会引发甲状腺功能不全，导致甲状腺激素降低，从而引起先天性甲减。
(2)甲状腺激素合成存在障碍，比如甲状腺合成和分泌过程中各种酶的功能不全或缺乏，致使甲状腺分泌不足。
2.与激素缺乏相关的问题：
(1)促甲状腺激素释放激素、促甲状腺激素缺乏，即下丘脑-腺垂体-甲状腺轴功能不全，也称中枢性甲减。
(2)甲状腺靶器官反应低下，甲状腺上的受体减少或缺乏，对TRH、TSH、T3、T4反应不敏感，无法形成有效的负反馈。
二、地方性先天性甲减：主要是由于孕妇在孕期缺碘，使得甲状腺激素合成减少，导致胎儿无法通过胎盘获取足够的碘来合成甲状腺激素。当新生儿出现甲减时应及时就医，以防止病情进一步发展。在日常生活中，也应当摄入一定量的碘元素，以避免甲减的发生。
总结：新生儿甲减病因分为散发性和地方性两类，前者包括甲状腺发育和激素相关问题，后者主要是孕期缺碘所致。出现甲减需及时治疗，日常应注意碘摄入。