肠上皮化生是胃黏膜上皮被肠型上皮细胞取代的一种病理现象，目前尚无特效药物能完全逆转肠上皮化生。但可以通过一些措施来控制病情发展，比如针对幽门螺杆菌感染的治疗，如果存在幽门螺杆菌感染，通常需要进行根除治疗，一般采用含有质子泵抑制剂、铋剂和抗生素的联合方案，疗程通常为10-14天。
病因干预方面
幽门螺杆菌感染治疗： 若检测出幽门螺杆菌阳性且伴有肠上皮化生，需进行根除治疗。目前常用的方案有含铋剂的四联疗法，即质子泵抑制剂（如奥美拉唑）+铋剂（如枸橼酸铋钾）+两种抗生素（如阿莫西林、克拉霉素），疗程一般为10 - 14天，通过根除幽门螺杆菌有可能改善胃黏膜的状况，延缓肠上皮化生的进展。不良生活习惯纠正： 要避免吸烟、酗酒，因为吸烟会影响胃黏膜的血液循环，酗酒会直接刺激胃黏膜，加重胃黏膜的损伤。同时要规律饮食，定时定量进餐，避免暴饮暴食，减少辛辣、油腻、过冷、过热等刺激性食物对胃黏膜的刺激。
定期监测方面
内镜随访频率： 一般建议患有肠上皮化生的患者定期进行胃镜检查及病理活检。轻度肠上皮化生者可每1 - 2年复查一次胃镜；中度肠上皮化生者每半年至1年复查一次；重度肠上皮化生者需缩短复查间隔，每3 - 6个月复查一次胃镜，以便及时发现病情是否有进展或出现其他病变。病理监测重点： 在复查胃镜时，重点关注肠上皮化生的范围是否扩大、程度是否加重，以及胃黏膜是否出现不典型增生等情况，不典型增生是癌前病变，对病情的监测至关重要。
药物辅助治疗方面
胃黏膜保护剂应用： 可以使用一些胃黏膜保护剂来保护胃黏膜，如硫糖铝，它能在胃黏膜表面形成一层保护膜，减少胃酸、胆汁等对胃黏膜的侵蚀；还有铝碳酸镁，不仅能保护胃黏膜，还能中和胃酸，缓解因胃酸过多引起的胃痛、反酸等症状。中药调理作用： 部分中药可能对肠上皮化生有一定的调理作用，比如一些具有健脾和胃、清热化湿等功效的中药方剂，但中药调理需要在专业中医医生的辨证论治下进行，根据个体的病情、体质等情况来组方用药，而且中药调理通常是一个长期的过程，需要患者坚持服用，并定期评估疗效。