肠胃紊乱的症状较多，常见的有消化不良，约有30% - 40%的肠胃紊乱患者会出现餐后饱胀、早饱等消化不良表现。
胃肠道不适症状
腹痛： 肠胃紊乱时可能出现腹痛，疼痛部位不固定，程度轻重不一，有的患者是隐隐作痛，有的则较为剧烈。一般疼痛时间没有规律，可能持续几分钟到数小时不等。腹泻： 部分肠胃紊乱患者会有腹泻症状，大便次数增多，每天可能3 - 5次甚至更多，大便质地较稀，呈糊状或水样，可能伴有未消化的食物残渣。便秘： 与腹泻相反，有些肠胃紊乱患者会出现便秘情况，排便困难，每周排便次数少于3次，大便干结，排出费力。
全身伴随症状
食欲不振： 约有20% - 30%的肠胃紊乱患者会出现食欲不振的情况，对食物缺乏兴趣，进食量明显减少。恶心呕吐： 少数肠胃紊乱患者会有恶心感觉，严重时可能出现呕吐，呕吐物多为胃内容物，一般无胆汁等其他物质。疲劳乏力： 长期肠胃紊乱的患者可能会有疲劳乏力的表现，感觉身体没劲儿，精力不充沛，影响日常生活和工作。
精神心理方面症状
焦虑抑郁： 大约有10% - 20%的肠胃紊乱患者会出现精神心理方面的问题，如焦虑、抑郁情绪，表现为心情低落、紧张不安、对未来担忧等。睡眠障碍： 肠胃紊乱可能导致睡眠障碍，患者入睡困难、睡眠浅、易惊醒，从而影响睡眠质量，长期睡眠不好又会进一步加重肠胃紊乱的症状，形成恶性循环。