男生上厕所小便刺痛，可能与以下原因有关：
1.尿道炎：尿道炎是男性泌尿系统常见的感染性疾病，可由细菌、支原体、衣原体等感染引起。尿道炎患者会出现尿频、尿急、尿痛等症状，其中尿痛就是指小便刺痛。治疗尿道炎的常用药物有头孢呋辛酯片、阿奇霉素分散片等。
2.膀胱炎：膀胱炎是膀胱的炎症，也会导致小便刺痛。此外，患者还可能出现尿频、尿急、尿不尽等症状。膀胱炎的治疗方法与尿道炎类似，可使用左氧氟沙星片、阿莫西林胶囊等药物。
3.前列腺炎：前列腺炎是男性前列腺的炎症性疾病，可分为急性前列腺炎和慢性前列腺炎。除了小便刺痛，前列腺炎患者还可能出现会阴部坠胀、疼痛、尿频、尿急、尿痛等症状。治疗前列腺炎的药物有前列舒通胶囊、前列安栓等。
4.泌尿系统结石：泌尿系统结石如肾结石、输尿管结石等，也可能导致小便刺痛。此外，患者还可能出现血尿、腰痛等症状。对于较小的结石，可通过多喝水、多运动等方式自行排出；对于较大的结石，则需要进行体外冲击波碎石或手术取石等治疗。
5.其他：除了上述疾病，包茎、包皮过长、尿道口狭窄等也可能导致小便刺痛。
如果出现小便刺痛的症状，建议及时就医，进行相关检查，如尿常规、尿培养、泌尿系统超声等，以明确病因，并采取相应的治疗措施。同时，患者应注意个人卫生，多喝水，勤排尿，避免憋尿，少吃辛辣刺激性食物。