指甲里有黑色斑点可能是由外伤、甲母痣、真菌感染等因素引起。具体如下：
一、外伤：若因外伤导致，会使指甲内出现淤血，进而有黑点形成，可能还伴有疼痛等不适。此时可进行局部热敷、适当按摩等操作，能促进局部血液循环，利于淤血吸收。
二、甲母痣：这是黑素细胞痣的一种，属于良性病变，通常对身体影响较小。若没有不适，一般无需治疗。但如果甲母痣明显增大，则可通过手术治疗，术后需合理消毒，防止局部感染。
三、真菌感染：由真菌感染时，可能引发指甲变形、指甲分离、脱落等情况，也会导致指甲内出现黑色斑点。建议取指甲皮屑做病理检查以确定真菌感染，确诊后可在医生指导下服用伊曲康唑、克霉唑等抗真菌药物。
总之，当发现指甲有黑色斑点时，需根据具体情况判断原因，并采取相应的治疗措施。