半夜醒来恶心想吐可能由多种原因引起，比如胃肠道疾病，像胃食管反流病就比较常见，大约有10% - 20%的人会在夜间出现反流导致恶心想吐。
胃肠道疾病因素
胃溃疡： 胃溃疡患者夜间胃酸分泌相对较多，容易刺激溃疡面，从而引发恶心想吐的感觉。一般胃溃疡是由于幽门螺杆菌感染或者长期服用非甾体抗炎药等因素导致。十二指肠溃疡： 十二指肠溃疡的疼痛特点常常是空腹痛，也就是在空腹时疼痛明显，夜间空腹状态下，胃酸刺激溃疡部位，也会出现半夜醒来恶心想吐的情况，多与胃酸分泌异常有关。
饮食因素
晚餐过量或进食不易消化食物： 如果晚餐吃得过多，胃肠需要长时间消化，夜间胃肠蠕动相对减慢，就可能导致食物反流，引起恶心想吐。比如晚餐吃了大量油腻、辛辣食物，像炸鸡、辣椒等，这些食物难以消化，会加重胃肠负担，容易在半夜引发不适。睡前饮酒： 酒精会刺激胃黏膜，影响胃肠的正常功能，即使睡前少量饮酒，也可能在半夜出现恶心想吐的症状，有研究发现大约15%因饮酒后出现胃肠道不适的人会在夜间有反应。
其他系统疾病因素
肝胆疾病： 胆囊炎患者在夜间平卧时，胆囊收缩可能会刺激周围组织，引发恶心想吐。例如慢性胆囊炎患者，夜间睡眠时体位改变可能诱发胆囊收缩，导致症状发作。内耳疾病： 美尼尔综合征患者除了有眩晕症状外，也可能伴随恶心想吐，而且这种不适可能在夜间发作，因为夜间人体的平衡调节等功能相对更易受影响，大约有5%的美尼尔综合征患者会在夜间出现恶心想吐伴随眩晕的情况。