孩子感染幽门螺杆菌后，部分孩子可能没有明显症状，而有症状的孩子可能出现消化不良相关表现，比如约半数孩子会有上腹部不适，可能表现为反复腹痛，疼痛没有明显规律，可轻可重；还可能出现食欲减退，孩子吃饭的兴趣降低，食量较平时减少。
消化系统相关症状
反酸、嗳气：有些孩子会出现反酸现象，感觉有酸水从胃里往上涌到口腔；也可能经常嗳气，就是不停地打嗝。一般每天可能会出现几次这样的情况。恶心、呕吐：较小的孩子可能表现为吐奶，年龄大些的孩子会说恶心，然后可能会呕吐，呕吐物多为胃内的食物。
生长发育相关影响
体重增长缓慢：如果孩子长期感染幽门螺杆菌，可能会影响营养的吸收，导致体重增长速度比同龄正常孩子慢。比如正常同龄孩子半年能长2 - 3公斤，而感染幽门螺杆菌的孩子可能半年只长1公斤左右。贫血：幽门螺杆菌感染可能引起孩子慢性胃黏膜炎症，影响铁的吸收，从而导致缺铁性贫血。孩子可能会出现面色苍白、口唇和甲床苍白等表现，活动后容易疲倦、乏力。
其他非特异性症状
口臭：幽门螺杆菌在胃内代谢可能产生有异味的物质，通过口腔排出，导致孩子出现口臭，而且这种口臭比较顽固，不容易通过刷牙等方式完全消除。精神状态改变：部分孩子可能会出现精神不振、烦躁不安等情况，因为身体不舒服影响了孩子的情绪和精神状态。