婴儿反复发烧可能由多种原因引起，其中感染性因素较为常见。比如病毒感染，像常见的呼吸道合胞病毒、流感病毒等引起的感染，有数据显示婴幼儿因病毒感染导致反复发烧的情况较为多见。细菌感染也会引发，例如肺炎链球菌、大肠杆菌等感染，也容易让婴儿出现反复发烧状况。
感染性因素导致
病毒感染：
上呼吸道病毒感染： 像鼻病毒引起的上呼吸道感染，婴儿会出现反复发烧，同时可能伴有鼻塞、流涕等症状，一般病程可能持续3 - 5天左右，但容易反复发烧。肠道病毒感染： 如柯萨奇病毒感染，除了反复发烧外，还可能出现皮疹、呕吐、腹泻等表现，发烧可能会持续数天。
细菌感染：
泌尿系统细菌感染： 婴儿泌尿系统被细菌入侵，会有反复发烧，同时可能出现尿频、尿急、尿痛的表现，小婴儿可能表现为哭闹不安等。肺部细菌感染： 肺炎链球菌引起的肺炎，婴儿会反复发烧，还会有咳嗽、气促等症状，体温可能会波动在38℃以上。
非感染性因素导致
自身免疫性疾病：
幼年特发性关节炎： 婴儿可能出现反复发烧，多为低热或中度发热，同时伴有关节肿胀、疼痛等表现，而且病情容易反复，需要进一步检查来明确诊断。川崎病： 主要表现为反复发烧，体温常超过39℃，持续5天以上，还可能伴有球结膜充血、口唇皲裂、手足硬性水肿等症状。
环境因素：
包裹过严： 如果给婴儿包裹得过于严实，就会影响身体散热，导致婴儿体温升高，出现反复发烧情况。比如在炎热的夏季，给婴儿穿盖过多过厚，就可能引发这种情况。室温过高： 室内温度过高，超过25℃以上，婴儿身体散热困难，也会出现反复发烧，一般降低室温后，体温可能会有所改善。