衣原体感染主要是由衣原体这种微生物引起的。衣原体分为肺炎衣原体、沙眼衣原体等不同类型，导致感染的原因主要有以下几方面。
传播途径导致感染
性传播： 这是衣原体感染的重要途径之一。在无保护措施的性行为中，衣原体可以通过性接触在男女之间传播。比如，有研究表明，在性活跃且不采取安全避孕措施的人群中，衣原体感染的发生率相对较高。母婴传播： 孕妇如果感染了衣原体，在分娩过程中，胎儿经过产道时可能会受到感染，从而引发新生儿眼部或呼吸道的衣原体感染。
自身免疫力因素
免疫力低下人群： 当人体自身免疫力较弱时，比如患有艾滋病、长期使用免疫抑制剂等情况，身体抵御衣原体的能力下降，就更容易受到衣原体的侵袭而发生感染。例如，艾滋病患者由于免疫系统受损，对衣原体的抵抗力大幅降低，感染衣原体的风险比正常人高很多。老年人： 随着年龄增长，老年人的免疫力会逐渐衰退，相对也更易感染衣原体，引发如肺炎等相关疾病。
环境因素影响
公共场所接触： 在一些卫生条件较差的公共场所，比如公共浴室、游泳池等，如果环境中存在被衣原体污染的情况，健康人接触后有可能被感染。不过这种情况相对较少见，但也不能忽视。比如公共浴室的毛巾、坐垫等，如果被衣原体污染，他人接触后就有感染风险。密切接触： 与已感染衣原体的人密切接触，像家庭成员之间、密切生活在一起的人群，如果有直接或间接的密切接触，也可能被传染。比如一家人中有人感染了沙眼衣原体，通过共用毛巾、脸盆等日常用品就可能导致其他家庭成员感染。