软疣主要通过局部治疗来去除，一般7~10天左右能有明显改善。
局部治疗方法一：夹除术
用镊子夹除： 医生会先用镊子将软疣小体夹住，然后向外拔除，过程中可能会有轻微疼痛。操作时要注意消毒，防止感染。适用情况： 单个或数量较少的软疣可以选择夹除术，这种方法比较直接，能快速去除软疣。
局部治疗方法二：刮除术
用刮匙刮除： 医生会使用刮匙将软疣的疣体刮除，之后要进行创面的处理，比如涂抹碘伏等进行消毒。一般刮除后局部会有轻微的创面，需要注意护理。注意事项： 刮除后要保持局部清洁干燥，短时间内避免沾水，以防感染。
局部治疗方法三：化学药物治疗
使用三氯醋酸： 可以用棉签蘸取三氯醋酸涂抹在软疣表面，它能腐蚀软疣组织，使软疣坏死脱落。不过涂抹时要注意不要接触周围正常皮肤，以免损伤正常皮肤。用药频率： 一般需要间隔几天涂抹一次，具体次数要根据软疣的恢复情况由医生决定。
全身治疗相关情况
免疫功能低下者： 对于免疫功能低下的患者，如艾滋病患者并发软疣时，可能需要考虑增强免疫力等综合治疗，但这比较复杂，需要在医生的全面评估下进行。一般来说，主要还是以局部治疗为主来处理软疣本身的问题。