小手指关节疼的原因可能有以下几点：
1.关节炎：关节炎是导致小手指关节疼的常见原因之一。其中，类风湿关节炎和骨关节炎较为常见。类风湿关节炎多发生在35-50岁女性，典型表现为对称性、多关节肿胀、疼痛、畸形，清晨起床时关节发僵，常伴有发热、乏力、类风湿结节、贫血等症状。骨关节炎可发于全身各关节，好发于负重较大的膝关节、髋关节、脊柱等，主要症状为关节疼痛、僵硬、肥大及活动受限，严重时可导致关节畸形。
2.感染：细菌、病毒、真菌等感染也可能导致小手指关节疼。比如，化脓性关节炎、骨髓炎、结核性关节炎等，都可引起小手指关节局部红肿、疼痛、皮温升高，甚至出现全身发热等症状。
3.创伤：手指关节受到直接或间接的创伤，也可能导致疼痛。比如，手指关节的扭伤、挫伤、骨折等，都可能引起小手指关节疼。
4.腱鞘炎：腱鞘是套在肌腱外面的双层套管样密闭的滑膜管，具有固定、保护和润滑肌腱的作用。如果长期、过度使用手指，可能导致腱鞘发生损伤性炎症，引起腱鞘炎，从而出现小手指关节疼痛、肿胀、活动受限等症状。
5.其他：自身免疫性疾病、内分泌疾病、肿瘤等也可能导致小手指关节疼。
如果小手指关节疼持续时间较长或症状较为严重，建议及时就医，以便明确病因，并采取相应的治疗措施。