男人感染HPV后表现多样，部分人可能没有明显症状，而有症状的情况中，常见的有生殖器部位出现异常赘生物。比如，男性感染低危型HPV时，可能在阴茎、阴囊、肛周等部位出现菜花状、乳头状的赘生物，这些赘生物大小不等，有的像小米粒，有的会逐渐增大融合。
皮肤黏膜表现
生殖器部位表现： 当感染低危型HPV6型、11型等时，男性生殖器部位可能出现丘疹，初期丘疹较小，颜色与皮肤相近，随着病情发展，丘疹可能逐渐增大增多，形成典型的尖锐湿疣表现，可单个存在也可成簇生长。口腔黏膜表现： 少数男性通过口交感染HPV，可能在口腔黏膜出现类似生殖器部位的疣体，但相对少见，一般是单个或多个小的颗粒状增生物。
潜伏感染情况
无明显外观改变： 很多男性感染HPV后处于潜伏感染状态，身体没有任何可见的异常表现，自身也没有不适症状，但体内携带病毒，具有传染性，这种情况大约占感染HPV男性的大部分比例。
与高危型HPV相关表现
长期感染风险： 若感染高危型HPV，如16型、18型等，在没有及时清除病毒的情况下，可能会引起持续感染，长期的持续感染有可能导致阴茎癌等恶性肿瘤，但这种情况发生的时间相对较长，一般需要数年甚至数十年的时间才可能逐渐发展为癌症，早期通常没有特殊的明显局部表现，可能仅表现为局部黏膜的轻微异常，容易被忽视。