早上起来的第一泡尿发黄且有异味，可能与以下因素有关。
1.生理性原因：
饮水过少：如果夜间饮水不足，导致尿液浓缩，会出现尿液发黄、有异味的情况。
饮食因素：食用了较多的辛辣、刺激性食物，或大量饮酒，也可能导致尿液发黄、有异味。
睡眠不足：长期睡眠不足，身体疲劳，可能会影响肾脏的功能，导致尿液发黄。
憋尿时间过长：尿液在膀胱内储存时间过长，会导致尿液中尿素等物质的浓度增加，从而使尿液发黄、有异味。
2.病理性原因：
泌尿系统感染：如尿道炎、膀胱炎等，炎症会导致尿液中细菌、白细胞等物质增多，使尿液发黄、有异味，并伴有尿频、尿急、尿痛等症状。
肝胆疾病：当患有胆囊炎、胆结石等疾病时，胆汁会排泄异常，进入血液循环，通过肾脏排泄，从而导致尿液发黄。此外，还可能伴有皮肤、巩膜黄染、食欲不振、恶心、呕吐等症状。
其他：如糖尿病、溶血性疾病等，也可能导致尿液发黄、有异味。
如果只是偶尔出现这种情况，可以通过调整饮食、作息等方式来改善。如果这种情况持续时间较长，或伴有其他不适症状，建议及时就医，进行相关检查，如尿常规、肝功能、腹部超声等，以明确原因，并进行针对性治疗。