牙齿咬合不齐是指牙齿排列不整齐、上下牙咬合关系异常的现象，其发生原因多样。比如在乳牙期，如果乳牙过早缺失、滞留，就容易引发牙齿咬合不齐，据统计，约有20%的儿童在乳牙期可能出现因乳牙问题导致的咬合不齐情况。
先天因素导致
遗传因素： 遗传是导致牙齿咬合不齐的重要原因之一。如果父母存在牙齿咬合不齐的情况，子女出现类似问题的概率会相对较高。例如，父母一方有明显的牙齿排列不整齐，子女发生牙齿咬合不齐的可能性比正常家庭出生的孩子要高出约30%。胚胎发育异常： 在胎儿发育过程中，如果受到某些不良因素影响，可能会导致牙齿发育、颌骨发育出现异常，进而引发咬合不齐。比如母亲在孕期受到病毒感染、接触放射性物质等，都可能干扰胎儿牙齿和颌骨的正常发育。
后天因素影响
不良口腔习惯： 长期有吮指、吐舌、偏侧咀嚼等不良习惯会引起牙齿咬合不齐。比如长期吮指的儿童，5岁以后就可能出现明显的前牙开颌（上下前牙无法正常咬合），大约有40%因吮指导致咬合问题的儿童会出现前牙开颌情况。换牙期问题： 换牙期如果出现乳牙滞留（乳牙未按时脱落）、恒牙早萌或萌出顺序异常等情况，都会影响牙齿的正常排列。例如乳牙滞留会占据恒牙萌出的位置，导致恒牙错位萌出，大约有15%的恒牙错位萌出是由于乳牙滞留引起的。疾病因素： 一些全身性疾病也可能影响牙齿和颌骨的发育，导致咬合不齐。比如儿童患有垂体功能亢进症，会使颌骨过度生长，出现牙齿排列紊乱等咬合不齐的表现。
牙齿缺失或多生牙影响
牙齿缺失： 个别牙齿缺失会导致相邻牙齿向缺失部位倾斜移位，对颌牙齿伸长，从而破坏正常的咬合关系。如果是上颌侧切牙缺失，约有60%的患者会出现相邻牙齿倾斜和对颌牙齿伸长的情况，进而引发咬合不齐。多生牙： 口腔内存在多生牙会占据正常牙齿的位置，使牙齿排列拥挤、错位，导致咬合不齐。多生牙最常见于上颌前牙区，大约有70%的多生牙会引起前牙区牙齿排列不齐和咬合异常。