急性肺栓塞的治疗需争分夺秒，一般来说，治疗方法主要包括药物治疗、溶栓治疗和手术治疗等。其中药物治疗中常用的抗凝药物有肝素等，能防止血栓进一步扩大。
药物治疗方面
抗凝治疗： 是急性肺栓塞的基础治疗。常用的抗凝药物有普通肝素，一般需要持续静脉输注，根据患者的凝血指标调整剂量。还有低分子肝素，通常皮下注射，每天1 - 2次，不需要频繁监测凝血功能，相对方便。抗凝治疗的目的是阻止血栓进展和复发，一般需要持续3 - 6个月甚至更长时间。溶栓治疗： 对于高危的急性肺栓塞患者，在发病14天内使用溶栓药物可能会有较好效果。常用的溶栓药物有尿激酶，它能激活体内纤溶酶原变为纤溶酶，溶解血栓。不过溶栓有出血风险，需要严格评估患者的出血倾向等情况。
手术治疗情况
肺动脉血栓摘除术： 这是一种比较积极的治疗手段，适用于病情非常严重、经积极的内科治疗无效的患者。手术需要在体外循环下进行，将肺动脉内的血栓摘除，但手术风险较高，需要患者的一般状况能够耐受手术。肺动脉导管碎解和抽吸血栓： 对于一些不适合溶栓和手术取栓的患者，可以采用这种方法。通过导管进入肺动脉，利用机械碎解血栓或者抽吸的方式去除部分血栓，改善肺循环。
一般支持治疗
呼吸支持： 如果患者有呼吸困难等症状，需要给予吸氧治疗。对于严重低氧血症的患者，可能需要使用呼吸机辅助呼吸。一般来说，要维持患者的血氧饱和度在90%以上。循环支持： 密切监测患者的血压、心率等循环指标。如果出现低血压等情况，可能需要使用血管活性药物来维持血压，比如多巴胺等药物，维持重要脏器的灌注。