同房后才知道来月经了，可能会有一些问题，但具体情况因人而异。一般来说，可能会出现以下几种情况：
1.感染：月经期间，女性的子宫颈口张开，此时同房容易将细菌带入子宫，引起感染。如果出现发热、腹痛、白带异常等症状，应及时就医。
2.子宫内膜异位症：同房时，子宫收缩可能将子宫内膜碎片挤入盆腔，导致子宫内膜异位症。这可能会引起痛经、性交痛等症状。
3.免疫性不孕：如果女性对男性的精液或精子产生抗体，可能会导致免疫性不孕。但这种情况比较罕见。
4.其他：极少数情况下，同房可能导致经血倒流，进入输卵管，引起子宫内膜异位症。
为了减少这些问题的发生，建议在月经期间避免同房。如果不小心在月经期间同房了，应注意观察身体状况，如果出现异常，应及时就医。同时，要保持外阴清洁，避免感染。此外，还应注意避孕，因为月经期间也可能排卵，导致意外怀孕。
对于一些特殊人群，如患有阴道炎、宫颈炎、盆腔炎等妇科疾病的女性，月经期间更应避免同房，以免加重病情。如果对月经期间的同房有疑虑，最好咨询医生的意见。