结石的治疗方法需根据结石的部位、大小等情况来定。比如肾结石直径小于6毫米时，可先尝试保守治疗。
药物治疗
利尿剂： 如氢氯噻嗪等，能增加尿液排出，帮助小结石排出，但要注意可能引起电解质紊乱等问题，需在医生指导下使用。碱化尿液药物： 对于尿酸结石，可使用枸橼酸氢钾钠等药物碱化尿液，改变尿液酸碱度，利于尿酸结石溶解。
手术治疗
体外冲击波碎石： 适用于直径在2 - 2厘米以下的肾结石或输尿管上段结石等。利用冲击波聚焦后击碎结石，使其随尿液排出体外，一般不需要开刀，对身体创伤较小，但可能需要多次治疗。经皮肾镜碎石取石术： 适用于较大的肾结石，通过腰部建立通道，插入肾镜，用激光等将结石击碎取出。手术创伤相对较大，但对于较大结石处理更彻底。输尿管镜碎石取石术： 适用于中下段输尿管结石等。经尿道插入输尿管镜，找到结石后用激光等碎石并取出。
生活方式调整
增加饮水量： 无论哪种结石，都要保证每天饮水量在2000 - 3000毫升以上，这样能增加尿液生成，促进小结石排出，还能稀释尿液，减少结石形成的机会。调整饮食： 对于草酸钙结石患者，要限制菠菜、苋菜、坚果等富含草酸的食物摄入；对于尿酸结石患者，要少吃动物内脏、海鲜、肉类等高嘌呤食物；对于含钙结石患者，要适当限制钙的过量摄入，但也不能完全不吃，因为长期低钙饮食可能会增加骨质疏松风险。