月经第二天可以查性激素六项。性激素六项检查通常在月经的第二天到第五天进行。该检查主要用于了解内分泌功能，辅助诊断与内分泌失调相关的多种疾病，包括：
一、原发性卵巢功能低下；
二、真性卵巢发育不全；
三、卵巢功能早衰；
四、垂体促性腺激素细胞腺瘤；
五、卵巢癌；
六、垂体性闭经；
七、下丘脑闭经；
八、多囊卵巢综合征；
九、继发性性功能减退等。
性激素六项检查包含六项指标：黄体生成素、卵泡刺激素、孕酮、雌二醇、催乳素、睾酮。检查前注意事项有：要清淡饮食，忌烟酒，晚上十点后禁食水，次日早晨需空腹检查，且检查前要停止使用性激素类药物。
总之，月经第二天可进行性激素六项检查，通过该检查能对多种内分泌相关疾病进行诊断，检查时要做好相关准备工作。