中性粒细胞计数低可能由多种原因引起。一般来说，成人中性粒细胞绝对值低于2×10^9/L时，就可称为中性粒细胞减少。
感染因素导致
病毒感染： 比如流感病毒、风疹病毒等感染，可能会引起中性粒细胞计数降低。例如，在流感流行期间，感染流感病毒的患者中，部分会出现中性粒细胞计数下降的情况。一般病毒感染引起的中性粒细胞减少，随着病毒感染的控制，中性粒细胞计数可能会逐渐恢复。细菌感染： 某些严重的细菌感染，像伤寒杆菌感染，也可能导致中性粒细胞计数低。伤寒患者在病程中，中性粒细胞往往会减少。
血液系统疾病影响
再生障碍性贫血： 这是一种骨髓造血功能衰竭的疾病，会导致全血细胞减少，其中就包括中性粒细胞计数降低。患者会出现贫血、出血、感染等一系列症状，血常规检查中中性粒细胞明显减少。骨髓增生异常综合征： 该病是一组造血干细胞克隆性疾病，骨髓出现病态造血，可引起中性粒细胞计数低。患者外周血中中性粒细胞等血细胞数量会有异常改变。
药物及化学因素所致
药物： 一些抗肿瘤药物、抗甲状腺药物等可能会引起中性粒细胞计数低。例如，部分化疗药物在抑制肿瘤细胞的同时，也会对正常的造血干细胞产生抑制作用，导致中性粒细胞生成减少。化学物质： 长期接触某些化学毒物，如苯及其衍生物，会影响骨髓的造血功能，进而使中性粒细胞计数降低。比如在一些化工厂工作，长期接触苯的工人，容易出现中性粒细胞减少的情况。
自身免疫性疾病相关
系统性红斑狼疮： 这是一种自身免疫性疾病，患者体内存在自身抗体，会攻击自身的血细胞等，可能导致中性粒细胞计数低。患者除了有中性粒细胞减少外，还会有发热、皮疹、关节痛等多系统受累的表现。