怀孕5周右侧小腹隐隐作痛，通常有以下几种原因：
一、正常生理反应：多数孕妇在怀孕5周时会出现小腹隐隐作痛的症状，这属于正常的生理性疼痛。之所以会产生这种疼痛，是因为随着子宫逐渐增大，胎儿也在逐步发育，这就使得子宫不断变大，子宫壁的牵拉会持续对肚子里的器官组织形成压迫，从而引起小腹疼痛。
二、先兆流产或胚胎停止发育：
1.若怀孕5周的孕妇出现右侧小腹隐隐作痛，同时伴有阴道出血、小腹下坠等症状，就可能是先兆流产或胚胎停止发育。
(1)孕妇需要及时就诊并完善相关检查，如果明确诊断为胚胎停止发育，那就需要尽快终止妊娠。
(2)如果是先兆流产，可以服用地屈孕酮、黄体酮胶囊等药物来降低流产概率，进行保胎治疗。
三、肠胃炎：孕妇如果饮食不当，或是食用了变质的食物、生冷的瓜果等，就容易引发肠胃炎，进而造成右侧小腹隐隐作痛。孕妇可以通过按摩足三里、内关等穴位来缓解胃肠道痉挛的症状，还可以服用益生菌药物，比如双歧杆菌三联活菌胶囊、双歧杆菌四联活菌片等以缓解胃肠道功能紊乱，必要时需要到消化内科就诊进行抗生素治疗。
四、宫外孕：宫外孕时会出现右侧小腹隐隐作痛的情况，并且伴有阴道出血，如果发生腹腔内大量出血，还会同时伴有呼吸急促、心跳加快、血压下降、晕厥等状况。宫外孕可能会对孕妇生命安全造成严重威胁，需要紧急就诊。
总之，怀孕5周右侧小腹隐痛的原因多样，孕妇需密切关注自身症状，如有异常应及时就医，以便明确原因并采取相应的措施。