鸿茅药酒曾被曝出一些问题，从正规的循证医学角度来看，目前并没有充分的科学证据表明鸿茅药酒具有特定的、超出普通保健范畴且被广泛认可的显著治疗效果。它不能替代正规的药物治疗。
其所谓“功效”缺乏严谨验证
目前没有大规模、高质量的临床研究能够确凿地证实鸿茅药酒对特定疾病有明确且可靠的治疗作用。它宣传的一些诸如对风湿、关节炎等病症的治疗效果，并没有经过严格的双盲对照试验等科学验证流程来支撑。
不适合替代正规医疗
对于一些疾病，比如严重的心脑血管疾病、恶性肿瘤等，必须依靠正规的医学检查、药物治疗、手术等专业医疗手段来进行治疗，绝不能寄希望于鸿茅药酒来起到关键的治疗作用。如果患者依赖鸿茅药酒而延误了正规的医疗诊治，可能会导致病情加重。
特殊人群需谨慎对待
- 孕妇和儿童：孕妇和儿童属于特殊人群，鸿茅药酒中的成分对于孕妇和儿童的安全性并没有经过充分的研究，为了避免可能对孕妇和儿童健康造成的潜在风险，这类人群不适合随意使用鸿茅药酒。
- 有基础疾病的人群：本身患有高血压、糖尿病、肝病等基础疾病的患者，鸿茅药酒中的某些成分有可能与他们正在服用的药物发生相互作用，从而影响基础疾病的控制或者引发其他健康问题，所以这类人群在考虑使用鸿茅药酒时，需要格外谨慎，最好先咨询医生的意见。