上呼吸道感染时可根据症状选择药物，一般70%~80%由病毒引起，可使用对症药物缓解症状。
对症缓解症状的药物
缓解发热、头痛等症状： 如果有发热、头痛、全身酸痛等症状，可选用对乙酰氨基酚，它能通过抑制前列腺素合成，达到解热镇痛的作用。缓解鼻塞、流涕等症状： 对于鼻塞、流涕明显的患者，可使用伪麻黄碱，它能收缩鼻黏膜血管，减轻鼻塞症状。
针对病毒感染的药物
抗病毒药物： 对于流感病毒引起的上呼吸道感染，在发病48小时内可使用奥司他韦，它能抑制流感病毒神经氨酸酶活性，阻止病毒释放，减少病毒传播。但普通病毒引起的上呼吸道感染，一般不推荐常规使用抗病毒药物，主要以对症治疗为主。
合并细菌感染时的用药
抗菌药物： 如果上呼吸道感染合并细菌感染，如出现咳黄脓痰、白细胞升高等情况，可根据病情选用抗生素，如青霉素类的阿莫西林（对青霉素不过敏者适用），或头孢菌素类的头孢克洛等。但使用抗生素需严格遵医嘱，不能自行滥用。
儿童上呼吸道感染用药注意
儿童特殊情况： 儿童用药需特别谨慎，比如对乙酰氨基酚用于儿童退热时，要根据体重按合适剂量使用。像1~3岁、体重10~15kg的儿童，一次用量约160mg；4~6岁、体重16~21kg的儿童，一次用量约240mg等。而且儿童不能随意使用成人的复方感冒药，避免药物过量等问题。同时，要注意观察儿童用药后的反应，如有异常及时就医。