排尿时尿道疼痛可能由多种原因引起。比如尿道炎就较为常见，约有30% - 40%的尿道炎患者会出现排尿时尿道疼痛的症状。
尿道炎导致的尿道疼痛
淋菌性尿道炎：由淋病奈瑟菌感染所致，主要通过性接触传播。除了排尿时尿道疼痛，还可能出现尿道口红肿、有脓性分泌物等表现。患者在发病前1 - 14天可能有不洁性接触史。非淋菌性尿道炎：多由沙眼衣原体、解脲支原体等感染引起。症状相对淋菌性尿道炎稍轻，排尿时尿道疼痛程度不一，可能伴有尿道刺痒、少量黏液性分泌物等。
膀胱炎引发的尿道疼痛
急性膀胱炎：常见于女性，主要是大肠埃希菌等细菌感染引起。除了排尿时尿道疼痛，还会有尿频、尿急，严重时可能出现血尿。一般起病较急，短时间内症状明显。慢性膀胱炎：多由急性膀胱炎迁延不愈所致。尿道疼痛症状相对较轻，可能时轻时重，同时伴有尿频、尿急等症状，病程较长，可持续数周或数月。
泌尿系统结石造成的尿道疼痛
尿道结石：多来自肾、膀胱等部位的结石排至尿道所致。除了排尿时尿道疼痛，还可能有排尿困难，严重时会出现尿流中断。结石较小的患者可能在排尿过程中感觉到疼痛位置有异物感。膀胱结石：主要症状是排尿疼痛，疼痛可放射至阴茎头部，还可能伴有排尿中断、血尿等。在排尿时，结石移动可能会刺激膀胱黏膜和尿道，引起疼痛。
其他可能因素
尿道损伤：多有尿道器械检查、性生活损伤等病史。受伤后排尿时会出现尿道疼痛，还可能有尿道出血等表现。比如尿道器械检查后，短时间内就可能出现排尿时尿道疼痛的情况。过敏反应：对某些物质过敏，如使用某些避孕套、清洗剂等，也可能导致尿道疼痛，同时可能伴有尿道局部瘙痒、红肿等表现。