胎儿酒精综合征的病因主要是孕妇在妊娠期间饮酒。孕妇一旦饮酒，酒精会通过胎盘进入胎儿体内，影响胎儿的正常发育。
酒精的摄入途径
孕期饮酒全过程： 从怀孕早期到晚期，只要孕妇饮酒，酒精都有可能对胎儿造成影响。比如在怀孕前3个月的关键器官形成期，胎儿对酒精的敏感性更高，此时饮酒更易引发胎儿酒精综合征相关问题。饮酒量的潜在影响： 目前并没有一个绝对安全的饮酒量阈值，但研究发现，即使是少量饮酒也可能增加胎儿出现问题的风险。例如，每天饮用相当于1杯含酒精饮料的量，就有可能对胎儿发育产生不良作用。
酒精对胎儿发育的影响机制
干扰细胞分裂与分化： 酒精会干扰胎儿细胞的正常分裂和分化过程。在胎儿的神经系统发育过程中，细胞需要精确的分裂和分化来形成正常的脑结构等。而酒精会打乱这个节奏，导致神经细胞的数量、形态和功能出现异常。影响营养物质吸收与运输： 酒精会影响胎盘对营养物质向胎儿的运输。胎盘是胎儿获取营养的重要通道，酒精会干扰胎盘的正常功能，使得胎儿无法获得充足的营养物质，如蛋白质、维生素等，进而影响胎儿的生长发育，尤其是大脑和身体器官的发育。
个体易感性差异
孕妇自身因素： 不同孕妇对酒精的代谢能力存在差异。有些孕妇体内代谢酒精的酶活性较低，酒精在体内停留时间更长，对胎儿的影响也就更大。例如，某些基因多态性会导致孕妇代谢酒精的能力不同，从而使胎儿暴露于酒精的程度有别。胎儿基因因素： 胎儿的基因也会影响其对酒精的易感性。一些胎儿的基因决定了他们在面对酒精时，更难抵御酒精带来的损害。比如某些与细胞修复、代谢相关的基因发生突变时，胎儿就更容易受到酒精的不良影响，增加患上胎儿酒精综合征的风险。