灰指甲最佳治疗法通常需要综合多种方式，一般外用药物结合口服药物是常见办法。比如外用阿莫罗芬搽剂，每周使用1 - 2次，坚持使用有一定效果。
外用药物治疗
阿莫罗芬搽剂： 它能干扰真菌细胞膜合成，从而发挥抗真菌作用。使用时要先清洁病甲，然后均匀涂抹在病甲及周围皮肤上，每周使用1 - 2次。环吡酮胺乳膏： 可改变真菌细胞膜的完整性，影响真菌代谢过程。直接涂抹在病甲处，每天1 - 2次，坚持使用对改善灰指甲有帮助。
口服药物治疗
伊曲康唑： 属于合成的三氮唑衍生物，具有广谱抗真菌作用。采用冲击疗法，即连续服用1周，停药3周为一个疗程，一般需要2 - 3个疗程。但使用前需要检查肝功能，肝功能异常者慎用。特比萘芬： 能特异性地抑制真菌角鲨烯环氧化酶，使真菌细胞膜形成过程中角鲨烯堆积，导致真菌死亡。成人每次0.25克，每天1次，疗程一般为2 - 3个月，同样需要关注肝功能情况。
手术治疗
拔甲术： 适用于单发的灰指甲。在局部麻醉下将病甲拔除，但术后恢复需要一定时间，而且拔甲后新长出来的指甲可能还会受到真菌影响，并且拔甲过程会有一定痛苦，术后要注意预防感染。激光治疗： 利用激光的光热效应破坏真菌。治疗时需要多次进行，每次治疗时间较短，但费用相对较高，不过激光治疗相对无创，恢复较快。
日常护理要点
保持足部清洁干燥： 每天用温水洗脚，洗完后及时擦干，尤其是脚趾缝之间。穿透气性好的鞋子和袜子，勤换鞋袜，避免真菌滋生的潮湿环境。避免交叉感染： 不要与他人共用拖鞋、脚盆、指甲刀等物品，防止将真菌传染给他人，也避免自身其他指甲被感染。定期修剪病甲： 定期适当修剪病甲，但要注意不要过度修剪，避免损伤甲周组织，修剪工具要单独使用并定期消毒。