小腿肌肉疼的原因主要包括以下这些：
一、剧烈运动后：人在进行剧烈运动时，身体内的营养物质会快速消耗，氧气供应明显不足，从而通过无氧酵解来补充能量，这会导致乳酸堆积，进而使小腿肌肉出现疼痛症状。
1.剧烈运动导致营养快速消耗。
2.氧气不足需无氧酵解补充能量。
3.无氧酵解产生乳酸堆积引发疼痛。
二、严重缺钙：如果患者缺钙比较严重，就会出现小腿肌肉的疼痛。
三、下肢静脉曲张：下肢静脉曲张会使静脉产生严重淤血现象，压力不断升高，患者会感觉患肢酸胀和疼痛，且久站后症状明显加重。
1.静脉曲张引发静脉淤血。
2.压力升高导致患肢不适。
3.久站后症状加重。
四、腰椎压迫坐骨神经：腰椎压迫坐骨神经会出现小腿的肌肉酸痛，若长时间受压，还可能出现小腿肌肉麻木或肌肉萎缩。可到医院骨科检查核磁以明确诊断。
五、小腿骨质本身问题：比如骨肿瘤、囊肿等，可到医院骨科检查X线明确诊断。
总之，小腿肌肉疼可能由多种原因引起，当出现这种情况时，应根据具体表现及时就医检查，以便明确原因并采取针对性的治疗措施。