做了卵巢囊肿手术后，多数患者仍可正常怀孕，但具体情况与多种因素有关。一般来说，单侧卵巢囊肿手术切除后，另一侧卵巢功能正常，怀孕几率约为正常女性的一半；如果是双侧卵巢囊肿，手术范围较大，对怀孕的影响相对更明显，怀孕几率可能会降低，但也有不少患者通过积极调理后成功受孕。
囊肿性质与手术方式的影响
良性囊肿：如果是良性卵巢囊肿，手术采用剥除术，尽可能保留正常卵巢组织，那么对卵巢功能影响较小，术后怀孕几率相对较高。比如直径小于5厘米的单纯性良性囊肿，行剥除术后，3个月左右可开始尝试备孕，多数能正常受孕。恶性囊肿：若是恶性卵巢囊肿，手术需要切除患侧附件甚至部分子宫、大网膜等，这会严重影响卵巢功能和生殖环境，怀孕几率大大降低，而且即使怀孕，孕期发生流产、早产等不良妊娠结局的风险也会增加。
术后恢复情况的影响
恢复良好者：术后恢复顺利，没有出现感染、粘连等并发症，卵巢功能恢复正常，月经规律，那么怀孕可能性较大。一般术后1 - 2个月月经复潮，若月经周期、经量等都正常，说明卵巢功能基本恢复，可在医生指导下监测排卵，适时备孕。恢复不佳者：如果术后出现盆腔粘连，影响输卵管与卵巢的正常关系，导致输卵管不通畅或蠕动异常，会阻碍卵子与精子结合或受精卵运输，从而降低怀孕几率。这类患者可能需要进一步做输卵管造影等检查，必要时进行相应治疗后再备孕。
个体差异的影响
年龄因素：年轻患者卵巢储备功能较好，术后怀孕几率相对较高；而年龄较大的患者，卵巢功能本身逐渐衰退，即使做了卵巢囊肿手术，怀孕难度也会增加，而且发生胎儿染色体异常等风险也会升高。一般35岁以下患者术后怀孕几率相对乐观，35岁以上尤其是接近40岁的患者，要尽早评估生育力并积极备孕。自身内分泌情况：术后内分泌失调的患者，如出现多囊卵巢综合征样改变，会影响排卵，进而影响怀孕。这类患者需要调节内分泌，恢复正常排卵后再尝试怀孕，可能需要借助药物等辅助手段来促进排卵。