小便快要结束时伴有疼痛，可能是以下原因引起：
1.尿路感染：如尿道炎、膀胱炎等，由于炎症刺激，会导致排尿时疼痛。还可能伴有尿频、尿急、尿不尽等症状。治疗方法包括使用抗生素（如左氧氟沙星、阿莫西林等），同时注意多喝水、勤排尿，有助于病情恢复。
2.尿路结石：如膀胱结石、输尿管结石等，结石移动时会刺激尿路黏膜，引起疼痛。疼痛通常较为剧烈，还可能伴有血尿。较小的结石可以通过多喝水、多运动自行排出，较大的结石可能需要进行体外冲击波碎石或手术治疗。
3.前列腺炎或前列腺增生：男性患者中较为常见，炎症或增生会导致前列腺充血、水肿，排尿时刺激前列腺，引起疼痛。还可能伴有尿频、尿急、尿不尽、会阴部坠胀等症状。治疗方法包括使用抗生素（如左氧氟沙星、头孢呋辛酯等）、α受体阻滞剂（如坦索罗辛、特拉唑嗪等）等药物，严重时可能需要进行手术治疗。
4.其他原因：尿道口息肉、膀胱肿瘤等也可能导致小便时疼痛。
如果出现小便快要结束时伴有疼痛的症状，建议及时就医，进行相关检查（如尿常规、超声等），明确原因后进行针对性治疗。同时，要注意个人卫生，多喝水、勤排尿，避免憋尿，少吃辛辣刺激性食物。如果症状持续不缓解或加重，应及时就医。