三岁宝宝耳朵疼可能与耵聍栓塞、外耳道炎、中耳炎等有关，也可能存在其他因素，需及时就医检查并针对病因进行治疗。
一、耵聍栓塞：三岁宝宝耳道内耵聍可能显著增多，形成局部耵聍栓塞。由于耵聍的压迫和刺激，会导致宝宝出现听力减退、耳朵疼甚至头痛等表现。这种情况下要尽快前往医院，由医生使用耵聍钩将耵聍取出，从而缓解症状。
二、外耳道炎：外耳道皮肤较为薄弱，三岁宝宝若外耳道发生感染引发外耳道炎，会造成外耳道红肿、脓性分泌物增多，进而刺激外耳道皮肤，引发不适，所以会出现耳朵疼的症状。可遵医嘱应用消炎止痛药物进行治疗，比如头孢克肟颗粒、红霉素软膏、盐酸洛美沙星滴耳液等。
三、中耳炎：宝宝耳朵疼可能是中耳炎所致。当宝宝患上中耳炎时，会因细菌感染导致耳道内黏膜溃烂化脓，从而出现耳朵疼的情况，还常伴有耳道流水或听力下降等症状。可遵医嘱应用氧氟沙星滴耳液，同时配合氧氟沙星胶囊、头孢克洛干混悬液等药物共同治疗。
四、其他：如淋巴结节炎、腮腺炎等，可能由于炎症刺激局部神经，引起耳朵出现放射性疼痛。建议遵医嘱服用消炎或抗病毒药物进行治疗，如蒲地蓝消炎口服液、阿莫西林颗粒、利巴韦林颗粒、头孢氨苄颗粒等。
总之，当三岁宝宝出现耳朵疼时，应尽快就医明确病因，并根据具体病因采取相应的治疗措施。