慢性萎缩性胃炎的治疗需要综合多方面因素，一般可以通过药物治疗、生活方式调整等方法来进行。对于幽门螺杆菌感染引起的慢性萎缩性胃炎，通常需要进行抗幽门螺杆菌治疗。比如，常用的方案是质子泵抑制剂（如奥美拉唑等）+铋剂+两种抗生素（如阿莫西林、克拉霉素等）联合使用，疗程一般为10-14天。
药物治疗方面
抑酸护胃药物： 如果患者有反酸、烧心等症状，常用的抑酸药有质子泵抑制剂，像奥美拉唑，它能抑制胃酸分泌，减轻胃酸对胃黏膜的刺激。还有H₂受体拮抗剂，如雷尼替丁，也可以起到减少胃酸分泌的作用。胃黏膜保护药物： 铝碳酸镁可以中和胃酸，同时保护胃黏膜；枸橼酸铋钾能在胃黏膜表面形成保护膜，促进黏膜修复。
生活方式调整
饮食方面： 患者要规律饮食，定时定量进餐。避免食用辛辣、油腻、刺激性食物，如辣椒、油炸食品等。还要戒烟戒酒，因为酒精和辛辣刺激食物会加重胃黏膜的损伤。建议多吃一些清淡、易消化的食物，比如小米粥、软面条等。一般建议每天保证三餐规律，每餐七八分饱即可。作息方面： 要保持充足的睡眠，每天尽量保证7-8小时的睡眠时间。避免熬夜，因为熬夜会影响身体的生物钟，进而影响胃黏膜的修复。
定期复查
复查频率： 一般建议患者每1-2年进行一次胃镜检查，同时检测幽门螺杆菌。如果幽门螺杆菌复发，需要再次进行规范的抗幽门螺杆菌治疗。对于伴有高级别上皮内瘤变的患者，可能需要更密切的监测，必要时进行内镜下治疗或手术治疗。