麦粒肿主要是由葡萄球菌感染引起的，尤其是金黄色葡萄球菌。约80%的麦粒肿是由这种细菌感染导致的。
病因之一：葡萄球菌感染
睫毛毛囊感染： 眼睑的睫毛毛囊及其附属的皮脂腺、汗腺受到葡萄球菌侵袭时，就容易引发麦粒肿。比如，经常用手揉眼睛，手上的葡萄球菌就可能接触到眼部，从而感染毛囊。睑板腺感染： 睑板腺被葡萄球菌感染时，也会引发麦粒肿。睑板腺分泌油脂，对眼睛有润滑等作用，一旦被葡萄球菌入侵，就会出现炎症反应。
病因之二：眼部卫生不佳
不注意眼部清洁： 长时间不清洁眼部，眼部分泌物堆积，为葡萄球菌等细菌的滋生提供了良好的环境，增加了患麦粒肿的风险。例如，儿童如果玩耍后不及时清洁眼部，就比较容易长麦粒肿。佩戴不合适的眼部饰品： 佩戴劣质的美瞳、不合适的假睫毛等眼部饰品，会对眼睑造成刺激，破坏眼部的正常防御机制，使得葡萄球菌等更容易侵入引发麦粒肿。
病因之三：机体抵抗力下降
免疫力较低人群： 像儿童、老年人以及患有糖尿病等基础疾病的人群，机体抵抗力相对较弱，更容易受到葡萄球菌等病原体的侵袭，从而增加了患麦粒肿的几率。比如，糖尿病患者由于血糖控制不佳，身体的免疫功能受到影响，患麦粒肿后恢复也相对较慢。长期疲劳人群： 长期熬夜、过度用眼等导致身体疲劳的人群，身体的抵抗力会下降，眼部的防御能力也会减弱，容易让葡萄球菌等趁虚而入引发麦粒肿。比如，一些经常熬夜加班的上班族，就比较容易长麦粒肿。