男性尿道炎的治疗药物需根据病因选择，常见引起男性尿道炎的病原体有细菌、衣原体、支原体等。一般来说，细菌感染引起的尿道炎常用抗生素治疗，比如左氧氟沙星等喹诺酮类抗生素有较好疗效，但具体用药需遵医嘱。
细菌感染导致的尿道炎用药
大肠杆菌感染： 常用药物有头孢类抗生素，像头孢克肟，它能抑制细菌细胞壁合成从而发挥杀菌作用。不过对头孢过敏者禁用。葡萄球菌感染： 可以考虑使用阿莫西林，它属于青霉素类抗生素，通过干扰细菌细胞壁合成来杀菌，但青霉素过敏者不能用。
衣原体感染引发的尿道炎用药
阿奇霉素： 是常用药物，能抑制细菌蛋白质合成。一般成人常用剂量有一定范围，但需在医生指导下使用，孕妇及哺乳期女性使用需谨慎评估。多西环素： 也可用于治疗衣原体感染引起的尿道炎，不过8岁以下儿童禁用，因为可能影响骨骼发育。
支原体感染造成的尿道炎用药
红霉素： 属于大环内酯类抗生素，能抑制细菌蛋白质合成。使用时要注意可能出现胃肠道反应，如恶心、呕吐等。罗红霉素： 同样是大环内酯类，相对来说胃肠道反应可能相对轻一些，使用时也需注意其可能的不良反应，像肝功能异常等情况需监测。男性尿道炎患者除了药物治疗，还要注意大量饮水，每天至少1500 - 2000毫升，这样能增加尿量，起到冲洗尿道的作用，帮助缓解症状。同时要避免不洁性生活，注意个人卫生，保持尿道口清洁。如果尿道炎症状持续不缓解或反复发作，要及时就医重新评估，调整治疗方案。