女泌尿系统感染常用的药物有抗生素类，一般治疗疗程通常需要3-7天左右。
抗生素的选择
喹诺酮类药物：常用的有左氧氟沙星等，这类药物通过抑制细菌DNA旋转酶，阻碍细菌DNA复制从而发挥杀菌作用，但18岁以下女性应避免使用，因为可能影响骨骼发育。头孢类抗生素：如头孢克肟，它能抑制细菌细胞壁的合成来杀菌，不过对头孢过敏的女性不能用。
不同感染情况的用药差异
单纯性下尿路感染：一般可以选用呋喃妥因，它在尿中浓度高，能有效杀灭泌尿系统的细菌，服用时要注意可能会有胃肠道不适等反应。复杂性尿路感染：可能需要根据细菌培养及药敏结果选择药物，如果是大肠埃希菌感染，可能会用到阿莫西林/克拉维酸等药物，但用药前需做相关检查明确病菌情况。
特殊人群用药注意事项
妊娠期女性：要谨慎用药，比如喹诺酮类药物妊娠期禁用，可选用相对安全的头孢类抗生素，但需在医生严格评估后使用，因为要考虑药物对胎儿的影响。哺乳期女性：部分药物可分泌至乳汁，像左氧氟沙星哺乳期女性应用时需暂停哺乳，而头孢类相对安全些，但也得遵医嘱使用。