十二指肠球炎的治疗主要包括一般治疗、药物治疗等。一般来说，通过规范的治疗，大多患者可以取得较好的效果。
一般治疗很关键
饮食调整： 患者要注意规律饮食，避免食用辛辣、油腻、刺激性食物，如辣椒、油炸食品等。同时，要避免饮酒，因为酒精会刺激十二指肠球部黏膜，加重炎症。一般建议每天定时进餐，每餐不宜过饱。生活方式调整： 要保持良好的生活作息，避免熬夜。保证充足的睡眠，每天尽量保证7 - 8小时的睡眠时间，这样有助于身体的自我修复，对十二指肠球炎的恢复有帮助。
药物治疗有方向
抑酸药物： 常用的有质子泵抑制剂，如奥美拉唑等。这类药物可以抑制胃酸分泌，减少胃酸对十二指肠球部黏膜的刺激，一般需要连续服用一段时间，比如2 - 4周左右。还有H₂受体拮抗剂，像雷尼替丁等，也能起到抑制胃酸的作用。胃黏膜保护剂： 例如铝碳酸镁，它可以在胃黏膜表面形成一层保护屏障，阻挡胃酸、胆汁等对黏膜的损伤。还有硫糖铝，能保护胃黏膜，促进黏膜修复。
针对病因治疗很重要
幽门螺杆菌感染的治疗： 如果是由幽门螺杆菌感染引起的十二指肠球炎，需要进行幽门螺杆菌的根除治疗。一般采用联合用药的方案，通常是质子泵抑制剂 + 两种抗生素 + 铋剂，疗程一般为10 - 14天。比如常用的方案有奥美拉唑 + 阿莫西林 + 克拉霉素 + 枸橼酸铋钾等。其他病因处理： 如果是因为胆汁反流等其他病因导致的十二指肠球炎，对于胆汁反流的情况，可以使用一些促进胃肠动力的药物，如多潘立酮等，促进胆汁排空，减少胆汁对十二指肠球部黏膜的反流刺激。