卵巢早衰的原因较为复杂，主要包括遗传因素、自身免疫性疾病、医源性因素、环境及生活方式因素等。
遗传因素
部分卵巢早衰与遗传有关，如X染色体相关基因异常等，这些遗传突变可能直接影响卵巢的正常功能和结构，导致卵巢过早衰退。
自身免疫性疾病
自身免疫性疾病可攻击卵巢组织，引发卵巢早衰。例如，自身免疫性甲状腺疾病等，免疫系统错误地将卵巢组织当作外来异物进行攻击，破坏卵巢的正常细胞，影响其内分泌和排卵功能。
医源性因素
某些医疗操作或治疗可能导致卵巢早衰。如化疗，化疗药物在杀死癌细胞的同时，也可能对卵巢的生殖细胞造成损伤，影响卵巢功能；卵巢手术，如卵巢肿瘤切除手术等，若手术范围不当或操作失误，可能破坏卵巢组织，导致卵巢早衰。
环境及生活方式因素
长期处于污染环境中，接触一些化学毒物等可能影响卵巢功能。此外，不良生活方式也有影响，如长期熬夜、过度吸烟饮酒等，这些因素可能干扰内分泌系统的正常调节，进而影响卵巢的正常生理功能，增加卵巢早衰的发生风险。