早起尿液发黄的原因包括：
一、尿液存储时间较长：如果患者睡前饮水量较少，且夜间没有排尿习惯，就会使尿液在膀胱中储存时间较长。这会导致尿液中的无机盐以及尿素等成分含量升高，从而使尿液颜色发黄，气味也会比较浓重。这种情况通常无需特殊治疗，可通过调整饮水习惯来改善。
二、肝炎：这是由多种原因引发的肝脏炎症性病变。其常见表现为肝功能异常，还有厌食、恶心、呕吐、右上腹不适、肝区疼痛等症状，严重时会出现尿液发黄。治疗上，患者一般可使用复方甘草酸苷片、异甘草酸镁等药物。
三、膀胱炎：指由于细菌感染以及其他非细菌感染因素（如药物、异物、结石等）引起的膀胱炎性病变。主要症状为尿频、尿急、尿痛或膀胱区疼痛，同时可能伴有尿液发黄现象。患者通常可应用头孢克肟、头孢地尼等药物进行治疗。
总结：早起尿液发黄可能由上述多种原因导致，需根据具体情况进行分析和处理。如果尿液发黄持续不缓解或伴有其他不适症状，应及时就医，明确原因并采取相应的治疗措施。