脑梗塞的治疗目前并没有所谓的“特效药”，但有几种常用的药物类别。一般来说，发病4.5小时内符合条件的患者可以使用阿替普酶进行静脉溶栓治疗，这是目前较为有效的恢复血流的方法之一。
溶栓类药物
阿替普酶： 属于重组组织型纤溶酶原激活剂，能激活纤溶酶原变为纤溶酶，溶解血栓，在发病4.5小时内使用可有效改善预后，但有严格的适用和禁忌证，比如近期有颅内出血等情况不能用。尿激酶： 也是一种溶栓药物，可直接激活纤溶酶原，使转变为纤溶酶而溶解纤维蛋白原及血栓，不过使用时机等也有严格要求。
抗血小板聚集药物
阿司匹林： 通过抑制血小板的环氧化酶，减少血栓素A2生成，从而抑制血小板聚集。一般建议脑梗塞患者若无禁忌证应长期服用，它可以降低脑梗塞复发的风险。但有严重胃肠道疾病、出血倾向等情况要慎用。氯吡格雷： 是一种二磷酸腺苷P2Y12受体拮抗剂，抑制血小板聚集的机制与阿司匹林不同，常与阿司匹林联合用于急性脑梗塞的治疗，或者在患者不能耐受阿司匹林时使用。同样也有出血等相关禁忌情况。
神经保护类药物
依达拉奉： 是一种自由基清除剂，可抑制脂质过氧化，从而抑制脑细胞、血管内皮细胞、神经细胞的氧化损伤。对于改善脑梗塞患者的神经功能缺损有一定作用，可促进患者神经功能的恢复。不过使用时要注意可能出现的肾功能损害等不良反应。胞磷胆碱钠： 可以改善脑代谢，促进大脑功能恢复，对脑梗塞后的神经细胞有一定保护作用，有助于患者神经功能的修复，但单独使用效果有限，多与其他药物联合应用。