眼睑痉挛的发病原因目前尚未完全明确，可能与多种因素相关。一般认为，约有1/3的眼睑痉挛患者可能与眼部疾病刺激有关，比如干眼症患者中，约有一定比例会出现眼睑痉挛的情况；另外，神经系统的异常也可能是诱因之一，像基底节区的病变等可能影响到眼部肌肉的控制；还有部分患者与精神心理因素有关，长期处于紧张、焦虑状态的人群中，眼睑痉挛的发生率相对会高一些。
眼部因素相关
眼部疾病刺激： 一些眼部的炎症性疾病，像结膜炎，长期的炎症刺激可能会影响眼部神经肌肉的调节，从而引发眼睑痉挛。例如，有研究发现，慢性结膜炎患者中，约15%左右会出现不同程度的眼睑痉挛症状。另外，倒睫也会刺激眼睑，导致眼轮匝肌不自主收缩，进而引起眼睑痉挛。倒睫是指睫毛向眼球方向生长，刺激眼球和眼睑，使眼部产生不适感，引发眼睑痉挛。
神经系统因素相关
基底节区病变： 基底节区是大脑中调节运动的重要区域，如果基底节区发生病变，比如存在微小的梗死灶或者变性等情况，就可能影响到对眼部肌肉运动的调控。这种病变可能是逐渐发生的，在病变发展过程中，会干扰神经信号的正常传递，使得眼部肌肉出现不自主的痉挛。一般通过头颅影像学检查，如磁共振成像（MRI）等，可以发现基底节区的一些异常改变。神经递质异常： 体内某些神经递质的失衡也可能与眼睑痉挛有关。比如多巴胺、γ - 氨基丁酸等神经递质，如果它们的代谢或者功能出现异常，会影响神经冲动的传导，导致眼睑肌肉出现异常收缩。目前研究发现，在眼睑痉挛患者的脑内，可能存在多巴胺能系统和γ - 氨基丁酸能系统的功能紊乱。
精神心理因素相关
长期精神紧张焦虑： 当人长期处于精神紧张、焦虑的状态时，身体的应激反应会增强。这种应激状态下，神经系统的调节功能可能会受到影响，进而波及到眼部肌肉的控制。例如，一些长期面临工作压力大、生活节奏紧张的人群，更容易出现眼睑痉挛的症状。据统计，在长期精神高度紧张的人群中，眼睑痉挛的发病率比正常人群高出约2 - 3倍。心理暗示作用： 心理因素还可能通过心理暗示来影响眼睑痉挛的发生和发展。如果一个人对眼部的不适感过度关注，这种心理暗示可能会强化眼部肌肉的异常反应，使得眼睑痉挛的症状加重或者持续存在。比如，有些人在知道自己可能患有某种眼部问题后，会不自觉地关注眼睑的状态，从而导致眼睑痉挛的情况更加明显。